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北京汉章针刀研究所共辖三个部门。
（一）针刀医学研究部
1．功能
由朱汉章教授领导的集科研、教育、临床观察为一体的针刀医学研究机构，是目前国内外针刀医学最高技术权威机构。
本研究所专门收治来自国内外的各科疑难杂病症患者，日常门诊由朱汉章的弟子主持，所有诊断、手术诊治均由朱汉章本人亲自进行。本研究所诊治收费标准较高。
2．人员组成
共有研究技术人员16名，其中博士生3名、硕士生1名、副主任医师或副教授职称以上7名。
3．建筑面积
研究所287平方米，另附观察病床18张，面积约360平方米。
（二）针刀医学培训部（中心）
1．功能
招收国内外高素质医学人材，由朱汉章教授及经过他本人严格审核在针刀医学理论和临床技术上有很高造诣的学生亲自授课，进行系统的针刀医学教育、培训工作，同时负责分布在国内外各培训分部的技术和行政上的领导工作。
目前已在国内外培训各级针刀医学人才3万余名。
2．人员组成
共有教师及行政管理人员9名，其中具有副高级职称以上教师4名。
3．建筑面积
除有可容纳百人并配有现代化教学设备的大型教室、办公室外还有三处可容纳百人食、宿的学员餐厅和宿舍，合计2000余平方米。
（三）针刀医疗器械生产部（厂）
1．功能
具有大批量生产朱汉章教授发明的33种专利针刀产品及与之配套的系列产品的能力，并负有监督、检查国内外针刀生产、销售情况防止假冒伪劣产品出现的责任。
2．人员组成
共有技术行政管理人员29名，其中各类工程师6名，管理及财务人员4名，其余为技术工人。
3．建筑面积
建有大、小厂房和各类车间、库房及办公室等共1200余平方米。
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